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人类肠道微生态是一个包含大量肠道微生物的复杂生态系统，包含了约～个微生物，这些微生物在长期的进化过程中与宿主相互依赖、相互制约，形成了和谐共生的整体，当这个和谐的整体受到破坏时，便会发生相应的疾病。
肠道微生态组成：
人体微生物群包括细菌、真菌、噬菌体以及病*，它们作为一个“器官”与宿主共生，创造出一个生态系统。其中最大的微生态即为肠道微生态，包括大约种不同微生物，总重量达1kg。人肠道微生物具有丰富的基因信息，是人类基因数目的倍，其中超过99％来自细菌，我们常常提到的肠道菌群主要指细菌，主要由厌氧菌、需氧菌及兼性厌氧菌组成，包括：硬壁菌、拟杆菌、放线菌门和变形菌门等，其中硬壁菌和拟杆菌为优势菌。
消化道中的正常菌群的种类和数量，在不同部位是不同的。胃内基本无活菌。空肠和回肠上部的菌群很少。结肠和直肠则有大量细菌，主要是类杆菌、双歧杆菌、大肠埃希菌、乳杆菌、铜绿假单胞菌、变形杆菌、梭菌等。1g干粪含菌总数在4.0×个左右，约占粪重的40％，其中99％以上是厌氧菌。肠道菌群受饮食、年龄等因素影响很大。多食蛋白质的人，大肠埃希菌生长旺盛；以淀粉为主食的人，乳杆菌较多。哺乳期婴儿的肠道菌群主要是双歧杆菌，占总菌数的90％左右；随着成长，双歧杆菌下降，类杆菌、乳杆菌、梭菌等逐渐增多。在母体内时胎儿肠道是无菌的，在消化道中的正常菌群的种类和数量，在不同部位是不同的。胃内基本无活菌。空肠和回肠上部的菌群很少。结肠和直肠则有大量细菌，主要是类杆菌、双歧杆菌、大肠埃希菌、乳杆菌、铜绿假单胞菌、变形杆菌、梭菌等。1g干粪含菌总数在4.0×个左右，约占粪重的40％，其中99％以上是厌氧菌。
肠道菌群受饮食、年龄等因素影响很大。多食蛋白质的人，大肠埃希菌生长旺盛；以淀粉为主食的人，乳杆菌较多。哺乳期婴儿的肠道菌群主要是双歧杆菌，占总菌数的90％左右；随着成长，双歧杆菌下降，类杆菌、乳杆菌、梭菌等逐渐增多。在母体内时胎儿肠道是无菌的，在出生过程中来自母亲阴道和肛门的细菌进入胎儿体内并在结肠内定植，其中主要是厌氧菌，如肠杆菌、链球菌等。出生后2d以后双歧杆菌才开始出现，在4～5d时成为肠道内的优势菌。断乳之后，双歧杆菌数量逐渐减少，并开始逐渐建立类似于成人的菌群模式。菌群构成与饮食方式的改变（如断乳）、年龄以及饮食结构密切相关。对于饮食结构稳定的个体来说，其结肠菌群构成也相对稳定，但是在不同个体之间差异较大。随着年龄增长，大肠杆菌、链球菌以及芽孢杆菌的数量逐渐增多而双歧杆菌数量减少。
肠道微生态对人体的作用：
对促进营养食物消化吸收、产生有益营养物质、抵御外来致病菌的侵入以及调节免疫机制等方面有着重要作用。肠道菌群的改变会激活肠道的免疫系统，促进肠道的炎症反应，改变肠道黏膜的通透性；菌群的代谢物，如致病菌的内*素等进入血液循环，对机体造成广泛损害，同时肠道菌群失调其对人体有益的生理作用也削弱。肠道微生态失调与炎症性肠病、肠易激综合征及结直肠恶性肿瘤在内的肠道疾病关系密切，也与肥胖症、脂肪肝、糖尿病、关节炎、心血管疾病、精神疾病等肠外疾病相关。
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